Musikarkiven ingår i handskriftssamlingen och de omfattar material av finländska och i Finland verksamma kompositörer: notmanuskript, utkast och annat arkivmaterial, så som brevväxling, dagböcker och anteckningar. I samlingen finns också material från musikföreningar och -förläggare samt musikforskare.
I handskriftssamlingen finns cirka 500 musikarkiv. Tidsmässigt finns det material från flera århundraden, men fokus ligger på 1900-talets konstmusik.
Samlingens kändaste arkivbildare är bland annat Jean Sibelius, Oskar Merikanto, Armas Launis, Fredrik Pacius, Einojuhani Rautavaara, men det finns också arkiv av samfund, så som Sulasol, Muntra Musikanter och Musiikki-Fazer.